A maioria dos grupos da 44ª Copa São Paulo de Juniores já conhece os times classificados para a segunda fase da competição, faltando ainda uma rodada para definir a primeira fase. O Botafogo de João Pessoa, que perdeu os dois primeiros jogos é um dos vai cumprir apenas tabela, no último jogo.
| Copa São Paulo 2013 | ||||||||||
| Grupo A | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | Grêmio Prudente | 4 | 2 | 1 | 1 | 0 | 4 | 0 | 4 | |
| 2º | Espigão/RO | 4 | 2 | 1 | 1 | 0 | 2 | 0 | 2 | |
| 3º | Grêmio/RS | 3 | 2 | 1 | 0 | 1 | 2 | 2 | 0 | |
| 4º | Aquidauanense/MS | 0 | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 6 | -6 | Eliminado |
| Grupo B | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | Coritiba/PR | 6 | 2 | 2 | 0 | 0 | 4 | 2 | 2 | |
| 2º | Cruzeiro/DF | 3 | 2 | 1 | 0 | 1 | 5 | 5 | 0 | |
| 3º | Mirassol | 3 | 2 | 1 | 0 | 1 | 3 | 3 | 0 | |
| 4º | Marília | 0 | 2 | 0 | 0 | 2 | 4 | 6 | -2 | Eliminado |
| Grupo C | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | Figueirense/SC | 6 | 2 | 2 | 0 | 0 | 7 | 1 | 6 | |
| 2º | Grêmio Novorizontino | 3 | 2 | 1 | 0 | 1 | 5 | 4 | 1 | |
| 3º | Ferroviária/SP | 3 | 2 | 1 | 0 | 1 | 4 | 5 | -1 | |
| 4º | Desp Ferroviária/ES | 0 | 2 | 0 | 0 | 2 | 1 | 7 | -6 | |
| Grupo D | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | Linense | 6 | 2 | 2 | 0 | 0 | 7 | 2 | 5 | |
| 2º | Atlético/MG | 4 | 2 | 1 | 1 | 0 | 4 | 2 | 2 | |
| 3º | Noroeste | 1 | 2 | 0 | 1 | 1 | 2 | 3 | -1 | |
| 4º | Rio Preto | 0 | 2 | 0 | 0 | 2 | 2 | 8 | -6 | Eliminado |
| Grupo E | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | América/SP | 6 | 2 | 2 | 0 | 0 | 7 | 0 | 7 | |
| 2º | Flamengo/RJ | 4 | 2 | 1 | 1 | 0 | 7 | 0 | 7 | |
| 3º | Rondonópolis/MT | 1 | 2 | 0 | 1 | 1 | 0 | 6 | -6 | |
| 4º | Santos/AP | 0 | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 8 | -8 | Eliminado |
| Grupo F | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | Náutico/PE | 4 | 2 | 1 | 1 | 0 | 4 | 1 | 3 | |
| 2º | Juventude/RS | 4 | 2 | 1 | 1 | 0 | 4 | 1 | 3 | |
| 3º | Portuguesa Desp | 1 | 2 | 0 | 1 | 1 | 2 | 5 | -3 | |
| 4º | Penapolense | 1 | 2 | 0 | 1 | 1 | 2 | 5 | -3 | |
| Grupo G | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | União São João | 6 | 2 | 2 | 0 | 0 | 5 | 1 | 4 | |
| 2º | Corinthians/SP | 4 | 2 | 1 | 1 | 0 | 5 | 2 | 3 | |
| 3º | XV de Piracicaba | 1 | 2 | 0 | 1 | 1 | 2 | 4 | -2 | |
| 4º | Americano/MA | 0 | 2 | 0 | 0 | 2 | 1 | 6 | -5 | Eliminado |
| Grupo H | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | Bahia/BA | 6 | 2 | 2 | 0 | 0 | 9 | 0 | 9 | |
| 2º | Audax | 6 | 2 | 2 | 0 | 0 | 9 | 1 | 8 | |
| 3º | Criciúma/SC | 0 | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 4 | -4 | Eliminado |
| 4º | Botafogo/PB | 0 | 2 | 0 | 0 | 2 | 1 | 14 | -13 | Eliminado |
| Grupo I | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | Atlético/PR | 6 | 2 | 2 | 0 | 0 | 6 | 1 | 5 | |
| 2º | Francana | 6 | 2 | 2 | 0 | 0 | 4 | 1 | 3 | |
| 3º | ASA/AL | 0 | 2 | 0 | 0 | 2 | 2 | 4 | -2 | Eliminado |
| 4º | Barras/PI | 0 | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 6 | -6 | Eliminado |
| Grupo J | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | Mogi Mirim | 4 | 2 | 1 | 1 | 0 | 8 | 3 | 5 | |
| 2º | Vitória/BA | 4 | 2 | 1 | 1 | 0 | 4 | 3 | 1 | |
| 3º | Monte Azul | 3 | 2 | 1 | 0 | 1 | 3 | 7 | -4 | |
| 4º | ABC/RN | 0 | 2 | 0 | 0 | 2 | 2 | 4 | -2 | Eliminado |
| Grupo K | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | Vasco da Gama/RJ | 6 | 2 | 2 | 0 | 0 | 3 | 1 | 2 | |
| 2º | Comercial | 3 | 2 | 1 | 0 | 1 | 3 | 2 | 1 | |
| 3º | Botafogo/SP | 3 | 2 | 1 | 0 | 1 | 3 | 3 | 0 | |
| 4º | Paysandú/PA | 0 | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 3 | -3 | |
| Grupo L | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | Goiás/GO | 6 | 2 | 2 | 0 | 0 | 7 | 2 | 5 | |
| 2º | Lemense | 3 | 2 | 1 | 0 | 1 | 1 | 2 | -1 | |
| 3º | Guarani | 3 | 2 | 1 | 0 | 1 | 2 | 4 | -2 | |
| 4º | Guarany/SE | 0 | 2 | 0 | 0 | 2 | 2 | 4 | -2 | |
| Grupo M | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | São Paulo | 9 | 3 | 3 | 0 | 0 | 12 | 2 | 10 | Classificado |
| 3º | Guaicurus/MS | 3 | 3 | 1 | 0 | 2 | 6 | 7 | -1 | Eliminado |
| 2º | São Carlos | 3 | 3 | 1 | 0 | 2 | 1 | 3 | -2 | Eliminado |
| 4º | União/MT | 3 | 3 | 1 | 0 | 2 | 2 | 9 | -7 | Eliminado |
| Grupo N | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | Santa Cruz/PE | 6 | 2 | 2 | 0 | 0 | 6 | 1 | 5 | |
| 2º | Sumaré | 3 | 2 | 1 | 0 | 1 | 2 | 3 | -1 | |
| 3º | Ceará/CE | 1 | 2 | 0 | 1 | 1 | 2 | 4 | -2 | |
| 4º | São Raimundo/RR | 1 | 2 | 0 | 1 | 1 | 1 | 3 | -2 | |
| Grupo O | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | Botafogo/RJ | 6 | 2 | 2 | 0 | 0 | 3 | 1 | 2 | |
| 2º | Taubaté | 4 | 2 | 1 | 1 | 0 | 4 | 2 | 2 | |
| 3º | Gama/DF | 1 | 2 | 0 | 1 | 1 | 3 | 4 | -1 | |
| 4º | Santo André | 0 | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 3 | -3 | Eliminado |
| Grupo P | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | Fortaleza/CE | 4 | 2 | 1 | 1 | 0 | 3 | 2 | 1 | |
| 2º | São Bernardo | 4 | 2 | 1 | 1 | 0 | 2 | 1 | 1 | |
| 3º | Caxias/RS | 1 | 2 | 0 | 1 | 1 | 2 | 3 | -1 | |
| 4º | Lideral/MA | 1 | 2 | 0 | 1 | 1 | 1 | 2 | -1 | |
| Grupo Q | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | Palmeiras | 4 | 2 | 1 | 1 | 0 | 6 | 0 | 6 | |
| 2º | Sertãozinho | 4 | 2 | 1 | 1 | 0 | 4 | 1 | 3 | |
| 3º | AD Confiança/SE | 3 | 2 | 1 | 0 | 1 | 1 | 6 | -5 | |
| 4º | Grêmio Barueri | 0 | 2 | 0 | 0 | 2 | 1 | 5 | -4 | Eliminado |
| Grupo R | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | Desportivo Brasil | 3 | 2 | 1 | 0 | 1 | 5 | 3 | 2 | |
| 2º | Atlético/GO | 3 | 2 | 1 | 0 | 1 | 3 | 3 | 0 | |
| 3º | Avaí/SC | 3 | 2 | 1 | 0 | 1 | 2 | 2 | 0 | |
| 4º | América/RN | 3 | 2 | 1 | 0 | 1 | 2 | 4 | -2 | |
| Grupo S | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | Velo Clube/SP | 6 | 2 | 2 | 0 | 0 | 7 | 0 | 7 | |
| 2º | Fluminense/RJ | 6 | 2 | 2 | 0 | 0 | 4 | 0 | 4 | |
| 3º | Atlético/AC | 0 | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 4 | -4 | Eliminado |
| 4º | Itaúna/MG | -1 | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 7 | -7 | Eliminado |
| Grupo T | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | Red Bull Brasil | 4 | 2 | 1 | 1 | 0 | 2 | 1 | 1 | |
| 2º | Atibaia | 4 | 2 | 1 | 1 | 0 | 2 | 1 | 1 | |
| 3º | Sport Recife/PE | 3 | 2 | 1 | 0 | 1 | 4 | 3 | 1 | |
| 4º | Guaratinguetá | 0 | 2 | 0 | 0 | 2 | 2 | 5 | -3 | Eliminado |
| Grupo U | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | São Caetano | 4 | 2 | 1 | 1 | 0 | 2 | 0 | 2 | |
| Cruzeiro/MG | 4 | 2 | 1 | 1 | 0 | 2 | 0 | 2 | ||
| 3º | São Francisco/BA | 3 | 2 | 1 | 0 | 1 | 3 | 3 | 0 | |
| 4º | São José | 0 | 2 | 0 | 0 | 2 | 1 | 5 | -4 | Eliminado |
| Grupo V | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | Santos/SP | 7 | 3 | 2 | 1 | 0 | 4 | 0 | 4 | Classificado |
| 2º | São Mateus/ES | 6 | 3 | 2 | 0 | 1 | 4 | 3 | 1 | |
| 3º | Remo/PA | 3 | 3 | 1 | 0 | 2 | 5 | 6 | -1 | Eliminado |
| 4º | Corinthians/AL | 1 | 3 | 0 | 1 | 2 | 0 | 4 | -4 | Eliminado |
| Grupo W | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | GE Osasco | 6 | 2 | 2 | 0 | 0 | 7 | 2 | 5 | |
| 2º | Internacional/RS | 6 | 2 | 2 | 0 | 0 | 6 | 2 | 4 | |
| 3º | Nacional/AM | 0 | 2 | 0 | 0 | 2 | 2 | 6 | -4 | Eliminado |
| 4º | Paulista | 0 | 2 | 0 | 0 | 2 | 2 | 7 | -5 | Eliminado |
| Grupo X | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | América/MG | 4 | 2 | 1 | 1 | 0 | 3 | 1 | 2 | |
| 2º | AA Flamengo/SP | 3 | 2 | 1 | 0 | 1 | 5 | 4 | 1 | |
| 3º | Juventus | 3 | 2 | 1 | 0 | 1 | 4 | 4 | 0 | |
| 4º | Vila Nova/GO | 1 | 2 | 0 | 1 | 1 | 1 | 4 | -3 | |
| Grupo Z | ||||||||||
| Col | Equipe | TP | J | V | E | D | GP | GC | SG | |
| 1º | Paraná/PR | 6 | 2 | 2 | 0 | 0 | 4 | 0 | 4 | |
| 2º | Ponte Preta | 3 | 2 | 1 | 0 | 1 | 3 | 2 | 1 | |
| 3º | Nacional/SP | 1 | 2 | 0 | 1 | 1 | 2 | 4 | -2 | |
| 4º | Tocantinópolis/TO | 1 | 2 | 0 | 1 | 1 | 1 | 4 | -3 | |
| TP = Total de pontos. J = Jogos. V = Vitórias. E = Empates | ||||||||||
| D = Derrotas. GP = Gols pró. GC = Gols contra. SG = Saldo de gols | ||||||||||
| Esta classificação é extra oficial. | ||||||||||
| O departamento de competições da FPF publicará oficialmente | ||||||||||
| a classificação completa no 1º dia útil após a realização dos jogos. | ||||||||||

















